科技处是学校主管科技工作的业务管理部门，下设综合科、自然科学项目管理科、人文社科项目管理科、成果与知识产权管理科、科研平台管理科、学报编辑部。校学术委员会、安徽农业大学社科联和安徽农业大学科协秘书处设在科技处。主要工作职责如下：

一、负责全校科研工作发展规划和年度计划拟定与组织实施。

二、负责科研管理有关规章制度制定、组织实施与修订。

三、负责科研信息收集整理、报道与咨询等工作，做好信息导向。

四、负责全校纵向科研项目计划组织申报、中期检查、验收结题、经费及成果管理。

五、负责科研平台和创新团队的组织申报和管理。

六、负责科技统计工作，处理学校学术委员会等的日常事务。

七、负责安徽农业大学自然科学版学报和社会科学版学报的编辑出版工作。

八、负责校社会科学联合会的日常管理工作。

九、协同做好科技成果转化、校科技奖励与业绩评分、科技宣传、科研档案、国际科技合作和学术交流等工作。

    十、完成学校和上级组织交办的其他工作。